A flora da ilha vive em zonas específicas. A compreensão dessas zonas ajuda na identificação e apreciação da flora. Desde os manguezais que cobrem a zona costeira húmida e os cactos de pera espinhosa das terras baixas áridas até as árvores de Scalesia e Miconia das zonas húmidas mais altas, as Galápagos abrigam uma interessante variedade de flora.
O clima nas ilhas varia desde as áreas baixas e secas ao longo da costa até as áreas altas e húmidas perto do topo dos vulcões. No total, existem 7 zonas no arquipélago:
